为进一步加强上海市湿地水鸟调查与监测，在国家林业局的统一协调下，根据《国家林业局野生动植物保护与自然保护区管理司关于开展全国第二次陆生野生动物资源调查冬季水鸟同步调查的通知》（护动函[2015]100号）的要求，上海市于2016年1月10日至1月13日，参与全国第二次陆生野生动物资源调查的同步调查，以期掌握上海市越冬期水鸟资源现状。上海市野生动植物保护管理站组织崇明东滩鸟类自然保护区管理处、九段沙湿地自然保护区管理署和上海野鸟会的志愿者开展了本次调查。
本次调查地点包括崇明东滩、崇明北八滧、崇明北湖、横沙东滩、青草沙、宝钢水库、炮台湾、九段沙、南汇东滩、奉贤边滩和淀山湖等11处沿海及内陆湖泊湿地，分设了37个观测点，出动人员74人次，覆盖面积34106公顷。
调查数据经初步汇总，共记录到水鸟52种47262只，国家级保护鸟类6种601只，IUCN受胁物种5种2267只，发现上海水鸟新记录1种。横沙东滩和南汇东滩水鸟数量最多，均超过万只，崇明东滩和九段沙其次，数量在七千余只。
上海市是水鸟的重要分布区。经多年调查，上海市已记录的水鸟种类达160余种，占全国水鸟种类的60%以上。水鸟是上海市生物多样性的重要类群，在生物多样性的研究与保护方面具有重要意义。
通过对水鸟的同步专项调查，将确定目前水鸟在上海的种类、数量、分布和栖息地特征，阐明水鸟在上海的主要分布区和主要栖息地类型，并通过与历史调查资料的比较，进一步了解近年来上海市水鸟的种群和栖息地的变化趋势，确定水鸟面临的主要威胁，提出水鸟及其栖息地的保护建议，为上海乃至我国的水鸟保护工作提供依据。