上海市青少年科学创新实践工作站是由上海市教委和科委于2016年实施的一个新项目，旨在整合高校、科研院所、科普教育基地等多方资源，通过项目实施厚植科学创新人才培养基础、完善科学创新实践育人模式、扩展青少年科普活动参与群体数量、提高学生科创兴趣和综合能力、更好地适应高中生综合素质评价深入推进的形势。该项目已成功开展了三年针对高中生的课程，2019年开始面向小学高年级至初中阶段学生进行试点。上海动物园于2018年下半年着手申请青少年生物多样性科学创新实践工作站，并于当年12月获得上海市科委立项，成为本市首批三个试点科普场馆之一。2019年2月22日下午，上海动物园召开青少年生物多样性科学创新实践工作站课题启动会议，标志着该项目正式启动。
会上，上海动物园总工程师王爱善向课题相关人员介绍了课题的总体情况、主要研究内容、考核指标、招生筹备等事宜。课题牵头部门就课程安排、人员分工、案例等内容做具体解读，相关人员还详细讲解了项目各项台账的要求及注意事项。上海动物园园长裴恩乐作为本课题的负责人，讲述了此项课题的由来，并强调了该课题对上海动物园巩固科研单位性质的重要性。裴园长还指出，要以此课题为载体，做好团队建设，通过编写优秀课件，向青少年传输科学思维，一方面提升青少年的科学创新能力，另一方面让公众意识到上海动物园不单纯是一个游玩的场所，更是一个适合学习的科普教育基地。 最后，王爱善总工提出下一步工作计划，一是工作站挂牌，二是开展课件编写培训，三是建立专家团队，四是优化人员分工，五是根据招生情况对课程时间进行微调。
目前，该课题已经完成了课程安排、人员分工、招生讨论会等前期筹备事宜，并完成了活动手册的编写。2019年，上海动物园将以依托工作站，利用自身独有的野生动物资源，针对小学高年级至初中阶段学生（10-15岁）的成长需求、认知特点和创新实践教育规律，设计一系列循序渐进、形式多样的科学探究课程。课程以生物多样性概念为背景，将包含科普讲解、科普讲座、互动体验、夏令营、科学实验五大类型，丰容、营养和兽医三大主题模块。以期通过课程激发青少年对生物多样性的热爱，对科学的兴趣，提升青少年科学创新综合素质，同时践行现代动物园综合保护和保护教育的伟大使命。