每月一次的消毒对于维护室外展区的环境以及避免微生物细菌的泛滥，起着重要的作用。众所周知，动物园里的野生动物身上或多或少会携带一些细菌或病毒。一般每周工作人员都会对水泥地展区进行消毒，但对于室外的泥地展区则因为场地大，消毒方式略有不同。
每月，上海动物园鸟队的工作人员都将使用一台消毒车，装入合适比例的消毒水，再使用喷枪进行大范围的喷洒，以确保雾状的消毒水可以覆盖到室外展区的每个角落。此次消毒的展区包括热带鸟馆、孔雀、雉鸡和鸵鸟。大部分的展区需要工作人员手握喷枪进入展区，喷洒消毒药水到地面以及植被即可。而热带鸟馆的室外场地较为特殊，每间笼舍单独分割，所以工作人员手持喷枪在场地外侧向里喷射雾状的消毒水，让水雾降下，覆盖到地面以及植被上。
在每月的消毒保障下，动物不易出现被细菌感染，同时也保证了饲养人员的健康安全。遇到节假日、疾病预防和疫情防控时，都会酌情增加相对应的消毒次数，给野生动物们提供一个健康成长的生活环境。
