为贯彻落实《全民科学素质行动规划纲要（2021-2035年）》，加强科普基础设施建设，推进全国科普教育基地发展，根据《全国科普教育基地创建与认定管理办法》，2021年10月，中国科协启动了2021-2025年度全国科普教育基地认定工作。
上海动物园被评为全国科普教育基地年代已久，本次是中国科协对现有全国科普教育基地的重新“洗牌”，含金量最高的“第一批全国科普教育基地”成为各家上海市科普基地必争的荣誉，上海动物园也积极参与申报认定工作。经过两轮材料申报、资格审查、市科委推优、中国科协评定等层层筛选，经官网公示，上海动物园被认定成功成为800家全国科普教育基地之一，其中上海市41家。
后续，中国科协还将对已命名的全国科普教育基地进行年度科普绩效评估和终期考核，设立科普专项支持其开展特色科普活动，而上海动物园也将继续开发开放优质科普资源，持续发挥科普教育功能，面向公众提供更多更好的科普公共服务。