水生植物及其构成的湿地有“自然之肾”的称誉，但在城市水生植物实际应用中还存在许多问题：布置时多考虑观赏性，少注意科学性，缺乏对水生植物生物学生态学特性的基本了解，植物配置时不考虑结构片层以及植物种间、种内竞争等生态问题，以致构建的水生植物群落结构不稳定，更不自然。
上海市园林科学研究所通过长期对上海市水生植物研究的基础上，运用植物学与生态学的相关理论开展水生植物引种及应用的系统研究，能够安全和有效地在湿地恢复和城市公园景观水体、河道沿岸绿化带建设中应用。目前相关科技人员已完成研究课题10个，发表研究论文20余篇。示范案例有辰山植物园特殊水生专类园，临港新城大芦线等数十个工程，取得较好的行业反响。