生物多样性e-Science云平台计划是辰山植物园迈入生物多样性信息学的第一步,项目将于2014年全面启动。目前项目的前期筹备工作已经逐步展开。
生物多样性信息学(Biodiversity Informatics)是以生物多样性三个基本层次(物种多样性、遗传多样性、生态系统多样性)的基础数据为主,以信息学手段研究数据的管理、分析与挖掘应用的新兴交叉学科。它兼有生物多样性科学以基础数据为中心的特点,又有信息科学演化快速的特点,近年来发展十分迅猛,是生物学科研机构学科建设的重要方向之一。它以数据为核心,为专业研究提供便捷的信息化手段,已经成为生物分类学、生态学、生物地理学及生物多样性相关学科群的公共基础,是大生物学发展的工具库和加速器,对于科研机构未来的发展意义重大。
根据国内外学科的发展状况,辰山提出了“生物多样性e-Science云平台”建设计划,依托上海领先的公共云设施与中科院的科研云平台,通过开放的平台化战略,向上通过搜索引擎实现互联网数据接入与知识集成,向下创建具有数据托管与专业软件服务的功能体系,帮助用户管理、编辑、发布专题数据资源,成为专题数据库的孵化器。以云平台建设筑巢引凤,汇聚科研社区的智慧,创建具有国际影响力的生物多样性门户网站和公共科研平台。
目前,平台部项目组已经开始了前期筹备工作,包括专业需求调研、信息化方案设计与创意征集,并进行了初步的技术选型与测试工作。基于阿里云主机完成了用户权限认证系统测试,并收集了Web前端框架、数据库、搜索引擎、自然语言处理、可视化表达等相关领域的备选开源技术,开始了全面的测试与筛选工作,为即将开始的平台建设工作打好基础。