6月16日晚至6月17日上午，特大暴雨袭击虹口，虹口区领导高度重视。区委书记吴清致电区防汛指挥部了解雨情灾情，区委副书记、区长曹立强到区防汛指挥部指导工作，区委副书记杜炯也致电区防汛指挥部了解情况。副区长、区防汛指挥部总指挥钱元运坐镇区防汛指挥部进行抢险指挥，并于6月17日一早召集区防汛指挥部有关成员单位召开了紧急会议，进行工作部署，要求房管、虹房集团做好危险房屋排摸，配合街道及时转移危房居民；要求建管委、中虹集团加强防汛墙渗水处堵漏措施和安全加固；要求绿化市容部门继续做好重车压桥工作和雨水口保洁工作。各部门按照钱元运副区长要求，迅速落实相关工作。
因降雨总量过大，同时由于虹口港泵闸虽已通水但因仍处于建设中，其工程效益还无法全部发挥，导致虹口港水位居高不下，一度持续高涨达到4.42米，影响了沿线泵站正常排水，加剧了虹口地区积水情况。此次强降雨中，虹口区接报441处房屋漏水，4个公用民防工程渗漏进水，6100余人受灾。强降雨期间，区内市政排水、公安消防、绿化市容等多支应急抢险队伍响应预案开展应急处置工作，中虹集团新虹口市政养护公司负责人在一线巡查指挥，派出120名量放水人员到各道路巡视，及时处置道路积水，区内3辆移动泵车分赴提篮桥新建路周边区域、哈尔滨路、香烟桥路等低洼地区抢排积水，全区环卫工人全部提前上岗清理雨水口垃圾，确保排水畅通。因内河水位高涨，区内香烟桥、东嘉兴路桥、柘皋路桥受河水顶托，为确保桥梁安全，区防汛指挥部调集压路机、平板车、土方车等重车对桥梁采取了压桥措施。对因水位高涨引起的内河防汛墙有5处伸缩缝渗漏水，区市政水务中心及时调集力量采取了堵漏措施，并派人值守观察。
经过市政泵站排水及应急排水辅助措施，至17日下午1时许住宅小区里弄积水基本退去，15时各道路积水也基本退去。