上海辰山植物园水质维护系统建设时，采用原位生态修复技术，通过人工种植苦草、金鱼藻、伊乐藻、轮叶黑藻、菹草等沉水植物来修复水底生境，构建起由沉水植物、挺水植物、浮叶植物等不同生活型水生植物组成的水生生态系统。如今，在辰山植物园水体中，沉水植物生长旺盛，覆盖了沈泾河整个河床以及东湖和西湖沿岸6-8米宽的水域范围，局部浅水区域达10米以上，覆盖度75-90%。
沉水植被形象地被比喻为“水下森林”，能有效减少底泥的再悬浮，为降解微生物提供了良好的气息场所。沉水植物在生长、繁殖过程中，通过根系吸收水体及沉积物中氮、磷等营养物质，然后分配到枝条，最后通过植物的活体释放或死亡腐烂释放到水体中。因此，在水体生态修复中，通过打捞沉水植物活体可以移除水体中的氮、磷等物质，达到控制水体富营养化和蓝藻暴发的效果。
上海辰山植物园为维护景观水体质量，每年从4月开始组织专职人员打捞园区沉水植物，据不完全统计打捞掉的种类主要有苦草、轮叶黑草、马来眼子菜、粉绿狐尾藻等种类，每个月的打捞量大约为50-60吨（鲜重），通过打捞植物可带走氮、磷量分别达125-150千克/月和18-25千克/月。在持续不懈努力下，目前辰山植物园园区水体氮、磷含量分别为8-15mg/L和0.03-0.1mg/L，水体透明度在1.2m-1.5m以上，水质达国家地表水III类标准。游客游览在辰山植物园内，可以清晰地看到一丛丛“宽意面”状的苦草，柔美纤细状的金鱼藻，“扁扁的豆荚状”的菹草，欢快畅游的各种鱼类。
